实验动物模型实验室的环境要求取决于实验室水平。根据实验室环境设施的分类，实验动物模型实验室分为正常环境、隔离环境和隔离环境三个等级。典型的实验动物模型环境须满足舒适水平，并控制实验室内的氨浓度。除上述要求外，屏障和隔离实验动物模型实验室还需要保证洁净度、室内压差和日大温差。因此，屏障式和隔离式实验动物模型实验室暖通空调系统具有生物洁净空调系统的特点。
实验动物模型的通风和空调功能：
(1)采用室外空气通风空调系统。
通常动物实验室饲养的动物密度较高，空气中含有氨气、硫化氢等气味。这是全新的直喷式通风。 空调系统可以保证动物实验室空气中的氨浓度不超过正常水平，从而保证实验动物的健康。
(2)大风量
除了正常的动物实验室外，清洁动物(SPF级动物和无菌动物)实验室还需要一个清洁的屏障或隔离环境。须进行一定量的空气交换，以确保所需的空气清洁度。
(3)空调负荷过重
实验动物模型实验室使用的是外接空气直接空调系统，进行大量的空气交换，其空调负荷必然比普通舒适性空调系统高很多。
(4)通风和空调系统的先进控制要求
为了保证动物实验结果的准确性，一个洁净的动物实验室需要全年基本恒定的环境条件。甚至白天的温度波动也低于4度这就需要空调系统的自动控制。根据外界天气条件和室内动物数量，及时调整空调通风系统的风量、冷风量和热量，使实验室环境参数的变化保持在规范允许的范围内。
(5)废气须处理后排放。
实验室排出的废气含有氨、硫化氢和其他有毒气体。直接排放会对实验室周围的环境产生负面影响。废气须经过处理以符合规格。浓度可以释放到大气中。
(6)有大面积通风和空调设备的房间
实验动物模型实验室空调负荷大，空调负荷大，风道尺寸大，设备设施多。房间和设备占地面积大。
(7)建设和维护成本高
实验动物模型实验室的通风空调设备非常密闭，需要大量的处理和一定数量的备件，其成本应该很高。加上设备的维护期，系统需要一年24小时运行，运行期间的能耗远高于典型的通风系统或舒适性空调系统。空调系统通常占动物实验设施总造价的1/3以上，运行能耗可达设施总造价的4/5。
